Virtuálna prehliadka sprístupňuje laboratórium starodávnej DNA verejnosti

Výskumníci vytvorili 360-stupňovú virtuálnu prehliadku laboratória starodávnej DNA na University of Connecticut, aby verejnosti a komunitám priblížili paleogenomický výskum, ktorý prebieha v priestoroch s kontrolovaným prístupom. Nástroj využíva virtuálnu realitu, interaktívne zvukové nahrávky, obrázky a videá na vysvetlenie práce v laboratóriu.

Snímka zobrazuje: Virtual Reality for Outreach and Community-Engagement in Paleogenomics: Development of a 360° Tour of an Ancient DNA Laboratory.

Zdroj: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42472044/

Prehliadka vznikla v softvéri 3DVista a používateľom umožňuje pohybovať sa vo virtuálnom prostredí laboratória. Súčasťou projektu je aj webová integrácia a využitie pri popularizačných aktivitách v spolupráci s Bioarchaeology Program nadácie Jamestown Rediscovery Foundation.

Autori rozdelili interaktívne prvky do troch tematických skupín. Orientation Audio predstavuje jednotlivé laboratórne priestory a ich funkcie. Information Hotspots ponúkajú doplňujúce informácie o zariadeniach a procesoch. Embedded Skills Videos názorne ukazujú základné metódy používané pri výskume starodávnej DNA.

Podľa autorov môže takýto formát zlepšiť dostupnosť a transparentnosť paleogenomického výskumu. Virtuálna prehliadka zároveň vytvára priestor na vzdelávanie a komunikáciu s verejnosťou, potomkami skúmaných populácií aj ďalšími komunitami, ktorých sa výskum týka. Nejde pritom o náhradu laboratórnej práce, ale o spôsob, ako priblížiť jej postupy a podmienky ľuďom, ktorí sa do kontrolovaných priestorov bežne nedostanú.

Prečo sú laboratóriá starodávnej DNA osobitné

Laboratóriá určené na analýzu starodávnej DNA pracujú v podmienkach, ktoré majú obmedziť prenos nežiadúceho genetického materiálu. Vo všeobecnosti preto ide o priestory s kontrolovaným prístupom a presne stanovenými pracovnými postupmi. Práve táto uzavretosť môže verejnosti sťažovať pochopenie toho, ako paleogenomický výskum prebieha.

Snímka zobrazuje: FIGURE 1 QR code for directly accessing the 360° Tour on the Jamestown Rediscovery Foundation's Historic Jamestowne website.

Zdroj: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42472044/

Virtuálna prehliadka umožňuje tento proces vysvetliť bez narušenia fungovania laboratória. Používateľ si môže prezrieť priestory, dozvedieť sa viac o úlohách zariadení a sledovať ukážky vybraných metód v digitálnom prostredí.

Ako funguje 360-stupňová prehliadka

360-stupňové prostredie poskytuje pohľad na laboratórium zo všetkých strán a prepája obraz s ďalšími informačnými prvkami. V tomto projekte sa používateľ medzi jednotlivými časťami laboratória orientuje pomocou zvuku, informačných bodov a vložených videí.

Snímka zobrazuje: FIGURE 2 360° photographs comprising the eight views of the 360° Tour.

Zdroj: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42472044/

Mohlo by Vás zaujímať  Pri Notre-Dame odkrývajú vrstvy parížskych dejín od Rimanov po stredovek

Takéto usporiadanie môže návštevníkom ponúknuť viac než statická fotografia alebo bežný textový opis. Záujemca si vyberá, ktorým priestorom a procesom sa bude venovať, pričom jednotlivé prvky mu poskytujú kontext priamo na mieste, kde sa daná činnosť vykonáva. Ide o všeobecnú výhodu interaktívnych digitálnych nástrojov, nie o samostatné meranie účinku v tomto projekte.

Čo môže projekt priniesť vzdelávaniu

Paleogenomika spája prácu s archeologickými nálezmi, laboratórne metódy a interpretáciu genetických údajov. Pre ľudí mimo odboru môže byť ťažké predstaviť si, ako tieto kroky na seba nadväzujú. Digitálna prehliadka ich môže vysvetliť v prostredí, kde sa skutočne vykonávajú.

Snímka zobrazuje: FIGURE 3 Examples of Information Hotspots and their locations in the four main chambers of the 360° Tour.

Zdroj: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42472044/

Autori projekt predstavujú ako nástroj verejnej komunikácie a komunitného zapojenia. Vďaka webovej dostupnosti môže slúžiť pri popularizačných aktivitách aj mimo samotnej univerzity. Konkrétny rozsah jeho využitia však závisí od spôsobu nasadenia a od publika, ktorému je prehliadka určená.

Význam spolupráce s komunitami

Výskum ľudských pozostatkov a minulých populácií sa netýka iba laboratórií. Môže mať význam aj pre komunity, ktoré sa k skúmaným ľuďom alebo archeologickým lokalitám vzťahujú. Preto autori zdôrazňujú potrebu komunikácie s potomkami skúmaných populácií, verejnosťou a ďalšími komunitami, ktorých sa výskum týka.

Virtuálna prehliadka môže v takomto dialógu ukázať, kde a akým spôsobom vedci pracujú. Transparentnejšie vysvetlenie laboratórnych postupov môže uľahčiť otázky a diskusiu o výskume. Samotný digitálny nástroj však automaticky nenahrádza dlhodobú spoluprácu ani rozhodovanie s komunitami.

Čo zostáva otvorené

Projekt ponúka prenositeľný rámec, ktorý by sa podľa autorov mohol uplatniť aj pri ďalšom vzdelávaní a komunikácii v paleogenomike alebo v širšom vedeckom prostredí. Zdroj však neuvádza, že by 360-stupňová prehliadka vyriešila všetky otázky spojené s dostupnosťou, dôverou alebo zapojením komunít.

Otvorená zostáva aj otázka, ako rôzne skupiny používateľov takýto formát prijmú a nakoľko im pomôže porozumieť vedeckým postupom. Ďalšie využitie preto bude závisieť od konkrétneho obsahu, spôsobu prezentácie a spolupráce s ľuďmi, ktorým je nástroj určený. Základný projekt University of Connecticut ukazuje najmä to, ako možno kontrolované laboratórne priestory sprístupniť prostredníctvom digitálneho prostredia bez fyzického vstupu do nich.

Zdroj: PubMed Research

Pôvodný článok: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42472044/